メラトニン (melatonin, N-acetyl-5-methoxytryptamine) は脳の松果腺から分泌されるホルモン。アミノ酸のトリプトファンからセロトニンを経て合成されるインドールアミン誘導体。

ヒトにおけるメラトニンの血液中濃度は昼に低く夜に高いサーカディアン・リズム（概日リズム）を示し、睡眠と関連している。夜行性の生物の場合も同様なリズムを示す。脳の松果体の他、植物などにもごく微量であれば見出される。また、化学合成で製造できる。抗酸化物質として働き体内の酸化を押さえる。

アメリカでは栄養補助食品サプリメントとして販売していて誰でも気軽に買うことができる。メラトニンは不眠治療に用いられるが、牛の松果体から精製された製品には狂牛病のリスクがある。現在市場にあるものの多くは、化学合成によるものと考えられている<ref>メラトニン原料と狂牛病について（厚生労働省）</ref>。